Ciao,
la tua domanda è un tantino vaga, quindi posso darti una risposta generale. Magari ti va in seguito di aggiungere qualche dettaglio sul tuo progetto.
In generale: la pasta termoconduttiva si applica tra due superfici perché, per quanto possano essere state lisciate e messe in aderenza, presentano dei micro-gap, cioè delle micro irregolarità sulla loro superficie di contatto.
Queste microirregolarità impediscono la migliore conduzione del calore e la pasta termica tende a riempirle e appianarle.
Quindi se non ci sono controindicazioni, può solo fare bene. Ma non conoscendo il tuo progetto completo anche gli utenti più esperti del forum difficilmente potranno aiutarti.
