PWM isolato ed a 6 V

[PietroBaima]

Sì, la resistenza va collegata tra Vcc e l'uscita dell'integrato.
In ingresso dovrai mettere una resistenza di limitazione per il led.
Se leggi il secondo data sheet troverai che la resistenza di pull up deve essere compresa tra e .
Il valore esatto dipende anche dal carico che dovrai andare a pilotare e dalla velocità di commutazione.
Se non devi pilotare carichi diversi da una porta logica e la velocità di commutazione è quella che hai scritto all'inizio dovrebbero andare bene.
Per il led puoi usare una resistenza da .

[PietroBaima]

al massimo servono 2mA

Ah, ok, allora devi andare su e accettare una caduta di 0.66V circa a livello alto, rispetto a Vcc.
Se non va bene devi mettere o un MOS o una porta logica.
Forse sarebbe meglio che mi specificassi cosa devi pilotare.