si ok, la xcorr usa internamente la fft, solo per motivi di prestazioni.... ok, forse per qualche motivo fa' qualche ragionamento piu' complesso e si perdono un po' di prestazioni, quindi va bene che tu l'abbia re-implementata a mano mediante le fft se noti una differenza di velocità
se invece noti differenze numeriche rimango un po' perplesso, ma nuovamente se sei sicuro dei risultati fai pure
la domanda è, cosa c'entra come implementi la tua my_xcorr (cioè il fatto che internamente usi la fft) con il tuo problema di normalizzazione? tieni semplicemente le cose separate e non dovresti aver problemi: ovvero la normalizzazione falla a posteriori, lavorando nel dominio temporale per trovare il coefficiente.
Chiarimenti sulla funzione xcorr del Matlab
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