Certo che l'ordine e' diverso; nel datasheet avrai trovato tutti i numeri in fila da 1 a 4 su di un lato e da 5 a 8 sull'altro. Negli schemi invece, per evitare grovigli di connessioni, si usa metterli come piu' conviene.
Non puoi sostituire un PNP con un NPN senza stravolgere tutto il circuito. Ogni transistor ha la sua funzione ben precisa ed e' calcolato per il circuito in cui viene impiegato.
Nessun problema. Fai pure tutte le domande che ti vengono in mente. L'importante, se vuoi portare a termine il lavoro con successo, e' attenersi ai componenti indicati ed allo schema relativo.
Non va bene. Devi trovare quello da 3V. Una soluzione alternativa potrebbe essere quella di fare uno step-up converter, quel circuitino non consuma tanto quindi sarebbe anche fattibile, ma visto che il 555 da 3V è reperibile mi sembra leggermente inutile.
Aggiungo che nel caso di fare uno step up converter sarebbe indispensabile conoscere il consumo di corrente del buzzer.